公開データの入手

このサイトの手順は、すべて公開データで再現できます。 患者データを用意する必要はありません。

公開データを使う理由

• 同意も匿名化も倫理審査も不要 — 手続きを気にせず練習できる
• 読者が同じデータで再現できる — 教材として成立する
• 公開・発表に使える — 学会スライドにもそのまま載せられる

骨の術前計画に使えるデータセット

データセット	内容	ライセンス	用途
TotalSegmentator dataset	全身CT 1204例＋臓器・骨のラベル	CC BY 4.0	汎用。最初はこれ
VerSe	脊椎CT＋椎体セグメンテーション	CC	脊椎
CTPelvic1K	骨盤CT＋骨ラベル	各サブセットによる	骨盤・寛骨臼
OAI	変形性膝関節症コホート（MRI・X線）	要申請	膝
TCIA	各種DICOMコレクション	コレクションごとに異なる	症例探し
Slicer 内蔵 Sample Data	CTChest など	自由	動作確認

ライセンスは必ず個別に確認してください

「公開データ」でも再配布や商用利用の可否はさまざまです。 特に TCIA はコレクションごとにライセンスが異なります。 使う前に必ず該当ページの利用条件を読んでください。

CC BY データを使うときの表示義務

TotalSegmentator dataset は CC BY 4.0 です。 これは「自由に使ってよいが、出所を明記すること」というライセンスです。

動画・スライド・記事で使う場合は、以下のような表示を入れてください。

クレジット表示の例

本資料の画像は TotalSegmentator dataset (CC BY 4.0) を使用しています。

Wasserthal J, et al. TotalSegmentator: Robust Segmentation of 104 Anatomic Structures in CT Images. Radiology: Artificial Intelligence. 2023.

動画の概要欄にもテンプレートとして入れておくと、書き忘れを防げます。

まず1例だけ落とす

全部で数百 GB あるので、練習には1例だけで十分です。

1. データセットの配布ページから1症例分をダウンロード
2. 展開して、DICOM または NIfTI のフォルダを確認
3. 3D Slicer にドラッグ＆ドロップ

DICOM の場合NIfTI (.nii.gz) の場合

DICOM モジュール → Import DICOM files でフォルダを指定します。

Tip

取り込み前に、DICOM データベースの保存先が クラウド同期フォルダになっていないか確認してください。

ファイルを Slicer のウィンドウにドラッグ＆ドロップするだけです。 DICOM データベースを経由しないので手軽です。

# スクリプトから読み込む場合
volumeNode = slicer.util.loadVolume(r"D:\data\ct.nii.gz")

自分で作るという手もあります

ライセンスを一切気にしたくない場合、次の方法が確実です。

方法	特徴
骨模型（Sawbones 等）を CT 撮影	完全に自由。教育用途では最強
3Dプリントした骨を CT 撮影	骨折形態を自由に作れる
自分自身の CT	本人同意の問題がない

とくに骨模型の CT は、骨折形態を自分で作れるうえ、 公開・改変・再配布が完全に自由なので、教材としての価値が高い方法です。

次のステップ

データが用意できたら、いよいよ骨を抽出します。

骨のセグメンテーションへ進む :material-arrow-right: